Tuttavia, il BMI presenta diverse limitazioni quando si tratta di valutare la salute di un individuo specifico. Prima di tutto, non distingue tra massa grassa e massa magra. Quindi, un soggetto molto muscoloso potrebbe essere classificato come sovrappeso o obeso, anche se ha bassi livelli di grasso corporeo. Inoltre, il BMI non considera la distribuzione del grasso corporeo. Diversi studi, per esempio, evidenziano ormai da tempo come il grasso viscerale, cioè quello che si accumula attorno agli organi interni, quindi dietro la parete addominale, risultando di conseguenza difficilmente palpabile, sia più dannoso per la salute rispetto al grasso sottocutaneo, che si localizza invece sotto la cute.

diabete di tipo 2, le malattie cardiovascolari, le dislipidemie ecc. Pertanto, il BMI si rivela un valido strumento per i ricercatori e i responsabili delle politiche pubbliche, per monitorare la salute di una popolazione e pianificare gli interventi di salute pubblica.